MATLAB Toolbox for Functional Connectivity

ResearchBlogging.org    今天NeuroImage刚in press 的一篇文章 (doi)，介绍了一个新的研究fMRI数据功能连通性 (functional connectivity)的工具箱 (MATLAB Toolbox for Functional Connectivity)。

    初步的扫了一下文章，这个工具箱针对的是已经定义好的若干区域之间的functional connectivity，不能做voxel-wise的分析，也不关注时间序列和其他因素的交互作用 (比如PPI)。不过在计算几个区域间functional connectivity的时候提供了很多种方法。对于整个时间序列，可以计算cross-correlation, cross-coherence, mutual information。而对于多于两个区域，还可以计算偏Partial cross-correlation/coherence/mutual information。对于事件相关序列，可以计算trial-by-trial的相关。对于有实验设计的fMRI序列，直接做correlation实际上意义不大。文章也提到了可以用残差序列或者低频滤波之后 (滤掉实验设计相关成分)的序列再进行functional connectivity分析。文章中还对各种方法进行了比较，有空要好好研究一下。

工具箱地址：http://groups.google.com/group/fc-toolbox

Zhou, D., Thompson, W., & Siegle, G. (2009). MATLAB toolbox for functional connectivity NeuroImage, 47 (4), 1590-1607 DOI: 10.1016/j.neuroimage.2009.05.089

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12平均律vs.自然律 频率vs.音高

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字母表示 7 种琴键音。从 A 到下一个 A 占用 8 个白键，俗称“八度音” octave 。国际标准 A 音为 440 Hz。钢琴上有许多 A 音，它们是：27.5，55，110，220，440，880…… Hz。请注意，每增加一个八度，用 Hz 为单位的频率增加为 2 倍。物理学中把 octave 说成是“倍频程”。钢琴调音师会把那种倍数关系拉开一些。1000 Hz 以上会拉得很开。在 500 Hz 以下，调音师人工调音中，倍数关系还是比较好的，非常接近 2 倍。 钢琴键盘上相邻的 7 个白键和 5 个黑键组成“十二半音”。相邻的白键和黑键之间，音高关系是半音。两个白键相邻，中间没有黑键的，也是半音的关系。两个白键相邻，中间有黑键的，白键之间是全音的关系。两个半音是一个全音。半音是全音的一半。 请注意，从 Hz 数值看，半音之间是 2 开 12 次方根的关系，也就是 1.059463 倍的关系。把它自乘 12 次，应该等于 2 。 在音乐家的听觉中，平均律并不好。他们更喜欢自然律： C 　D 　E 　F 　G 　A 　B 　C 264 297 330 352 396 440 495 528 它们之间有一种和谐悦耳的关系，也就是简单的比例关系，例如 C 与 G —— 2 : 3 、 E 与 A —— 3 : 4 、 G 与 B —— 4 : 5 、 E 与 G —— 5 : 6 ， 各自之间分别是最简单的比例关系。 半音 E 与 F 、B 与 C —— 15 : 16 的比例关系。它们是音乐带来悦耳感受的基本依据。 在有些乐器中自然律转调很不方便，所以钢琴要用 12 平均律。平均律与自然律的误差极小。 平均律的半音单位（st）跟 Hz 数值之间很容易换算，对于语音研究来说，它有重要的用途。
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